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发稿时间：2020-12-15来源：天昊生物

rna的m6a修饰研究，价格不菲，关键样品的损耗量也大。如何能在做实验前做点数据挖掘工作，少走点弯路呢？今天，小编为大家介绍几款rna m6a甲基化研究常用（而且打得开）的数据库，请果断收藏！

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mthfr基因有7个m6a修饰位点，每个位点的注释信息包括了基因组位置，基因位置，来源文章id，检测技术，细胞系/组织，是否有对应snp编号，是否处于rna结合蛋白结合区，是否处于剪切区域，是否属于gwas位点，是否存储于突变数据库等。

  b：甲基化水平（这里显示了所有样本的甲基化修饰水平，可以在红框内选样本类型，绿框内选择处理方法）

• 网址：http://rna.sysu.edu.cn/rmbase/

• 开发团队：中山大学生命科学学院屈良鹄教授团队

• 参考文献：rmbase v2.0: deciphering the map of rna modifications from epitranscriptome sequencing data. jia-jia xuan, wen-ju sun, ke-ren zhou, shun liu, peng-hui lin, ling-ling zheng, liang-hu qu*, jian-hua yang*.

• 数据库功能：rmbase v2.0整合了大量的表观转录组测序数据，探索rna的转录后修饰，以及它们与microrna结合、疾病相关snps和rna结合蛋白（rbp）的关系。rmbase v2.0扩展了566个数据集，包括来自47项研究13个物种的1 397 244个修饰位点，比上一版本扩展了约10倍。它包含约1 373 000个n6-甲基腺苷(m6a)修饰位点信息、5 400个n1-甲基腺苷(m1a) 修饰位点信息、9 600个假尿苷(ψ) 修饰位点信息、1 000个5-甲基胞嘧啶(m5c) 修饰位点信息、5 100个2′-o-甲基化(2′-o-me)和约2 800个其他100种类型的修饰。

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