英文题目：phylogenetic relationships in chinese oaks (fagaceae, quercus): evidence from plastid genome using low-coverage whole genome sequencing
中文题目：中国栎类(壳斗科，栎属)的系统发育关系：利用低覆盖度全基因组测序的质体基因组证据
期刊名：genomics
发表时间：2021年5月
影响因子：6.209
栎属植物作为一个物种丰富、分布广泛、寿命长，特别是伴随着广泛的杂交和渐渗的谱系树木，具有重要的经济和生态价值，在进化研究中也备受关注。之后利用完整的质体序列、蛋白质编码外显子和密码子位置不同的数据集，通过最大似然（ml）和贝叶斯推理（bi）方法构建了6个进化树。根据不同的方法获得的拓扑几乎一致。中国栎属之间的系统发育关系较好得以构建，并在大多数节点得到了很强的支持度(图2)。
图2、基于质体基因组蛋白质编码外显子的最大似然（ml）和贝叶斯推理（bi）构建的中国栎属系统发育树。
最后，根据大于150的有效样本量来估计了中国栎属的分歧时间。其中值得一提的是，台湾种与中国大陆种的分歧时间大约在16.03ma（图3）。
该论文西北大学杨颜慈博士为第一作者，赵贵仿教授为通讯作者，研究得到了国家自然科学基金的资助。
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