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发稿时间:2020-08-26来源:天昊生物

很多人觉得数据分析入门很难,但随着b站和公众号上的学习资源越来越多,学习数据分析已经变得非常简单。以下面为例,从一张规则的表格中,根据门水平名称,生成对物种门水平的表格文件。



in [1]:

import pandas as pd



读取文本文件pd.read_table,读取excel文件,

可以用df = pd.read_excel('*.xlsx',sheet_name='*')。

in [2]:

df = pd.read_table('subsample_otu.tax.0.03.xls')


如下图所示,门水平有12个门的数据。






in [3]:

df['phylum'].unique()
out[3]:


array(['acidobacteria', 'actinobacteria', 'armatimonadetes',
       'bacteroidetes', 'chloroflexi', 'firmicutes', 'fusobacteria',
       'gemmatimonadetes', 'planctomycetes', 'proteobacteria',
       'spirochaetes', 'synergistetes'], dtype=object)




根据门水平名称,提取对应门水平的信息,并生成以门水平名称命名的excel文件。

in [4]:

for i in df['phylum'].unique():
    df[df['phylum']==i].to_excel(i ".xls",index=false)
out[4]:



往期相关链接:

1、r基础篇






2、r进阶


3、数据提交

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4、表达谱分析

5、医学数据分析



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作者:大熊

审核:有才

来源:天昊生信团




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